種子的發芽率受到多方面因素影響，溫度濕度，水分等，其中水分時必須啊的一個重要條件，干燥種子含水量少，很多重要生理機能無法進行，所以需要水分。做夠的水分供應是種子萌發的重要條件，但是，如果水分過多，會引起種子缺少氧氣，無法呼吸，引起種子腐爛。在發芽過程中水分的控制是種子發芽成功的因素，種子發芽率試驗中，為保證環境中的個參數的穩定，通常使用人工氣候種子發芽室進行操作，通過該款儀器進行控制各項參數。

　　在人工氣候種子發芽室中，能夠調節室內的溫度、濕度等參數，但是對于水分含量的控制則是沒有很大的效果，因種子發芽過程中需要的水分含量比較的多，多是通過人為地進行調控。不同作物種子發芽的需水量不同，發芽試驗用水：干凈，無毒無害，富氧，不含酸堿，PH6~7.5，自來水。在進行水分管理的時候，要結合實地來進行操作，不僅僅要考慮種子的蓄水特性，同時還要進行考慮發芽床應有的特性來進行決定。比如砂床：可按干砂飽和含水量的60~80%加水；濾紙床：水分達到飽和，略有余水；土壤床：加水量是風干土重的20~25%，手握土粘成團，手指一壓土團就碎。不同類型的種子所需要的水分均是不一樣的，主要有：禾谷類等中小粒種子按60%加水；豆類大粒種子加水80%。

　　人工氣候種子發芽室能夠保證以及控制環境中的溫度、濕度以及光照強度，但是水分因子則是要認為的控制，因而在種子發芽試驗期間要定期定量向發芽床上補充水分，以保持其濕潤、水分適宜、一致。